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장기 교육프로그램

​장기 교육프로그램은 연구실무자 대상으로 실습 중점 교육을 수행합니다. 메타게놈, 메타대사체 등 메타오믹스와
관련된 실험 및 데이터 분석을 배울 수 있습니다. 각 교육프로그램 중 교육 대상자 수요에 따라 원하는 교육을
선택하여 수강할 수 있습니다. 

2025년도 ​연구실무자 대상 1차 장기 교육프로그램 1-2월 진행

2025년도 연구실무자 대상 2차 장기 교육프로그램 (날짜 미정)


*장기 교육프로그램에 대한 상세일정은 유동적으로 변할 수 있으며, 원활한 교육을 위해
교육 당 수강 인원을 8명으로 제한하고 있습니다.

  • 2025년도 연구실무자 대상 1차 장기 교육프로그램 일정 및 시간표

메타게놈 실험 및 분석법 Ⅰ (Amplicon sequencing)​​

  • 시료에서 DNA를 추출한 후 이를 이용하여 16S rRNA amplicon 분석에 대한 실습을 진행
     

  • 16S rRNA amplicon sequencing을 위한 메타게놈 DNA 추출과 amplication 및 prep 등에
    대한 실습

     

  • 16S rRNA amplicon sequencing 데이터를 이용한 quality control, OTU clustering 및 ASV denoising, taxonomy classification, phylogenetic analysis 및 diversity 분석에 대한 실습

메타게놈 실험 및 분석법 Ⅱ (Whole metagenome)

  • 시료에서 DNA 추출 및 whole metagenome 분석에 대한 실습을 진행
     

  • Whole metagenome shotgun sequencing을 위한 메타게놈 DNA 추출, DNA fragmentation 및 
    whole metagenome ​library 제작에 대한 실습

     

  • Whole metagenome shotgun sequencing에서 생성된 raw sequence data를 이용한 quality control, merging, host gene removal, taxonomy and functional feature identification
    분석에 대한 실습

메타전사체 실험 및 분석법 (Metatranscriptome)

  • 시료에서 total RNA를 추출하고, 이를 이용하여 metatranscritome 분석을 위한 실험 및 분석 과정에
    대한 실습

     

  • Metatranscriptome sequencing을 위한 mRNA enrichment, cDNA library 제작에 대한 실습
     

  • Metatranscriptome sequencing 데이터를 이용한 quality control, rRNA removal, mRNA
    annotation 분석에 대한 실습

사체 실험 및 분석법 (Metabolome)

  • 마이크로바이옴 유래 비표적 대사체 분석에 대하여 분변 대사체 추출 및 reconstitution에 대한
    이론적 교육 및 실습

     

  • 고해상도-액체크로마토그래피 질량분석시 (UPLC-Orbitrap MS) 기반의 비표적 대사체 분석법의 이론 교육 및 실습 
     

  • 비표적 대사체 데이터 분석법에 대한 대사체 annotation, missing value imputation, alignment 및 identification tool에 대한 실습
     

  • QC sample을 통한 분석 적합성 판단 및 다양한 통계분석에 대한 실습

단백체 실험 및 분석법 (Proteome)

  • 마이크로바이옴 시료의 단백질 추출 및 정제, 효소 (protease) 처리, 량 분석기 사용에 관한
    교육 및 실습

     

  • MASCOT, proteome discoverer와 같은 분석 소프트웨어를 활용한 질량 분석, 스펙트럼 데이터 처리 (분석 조건 설정, 데이터베이스 선택, 정량 분석 등)에 대한 실습
     

  • 생물학적 해석을 위한 단백질-단백질 상호작용, 대사 경로, 질병과의 연관성 등을 분석할 수 있는
    소프트웨어에 대한 교육
    및 실습

배양체 분석 및 동정 (Culturome)

  • 인체 시료에 존재하는 호기성 및 혐기성 미생물을  분리 배양하고 이를 분류학적으로 동정하는 실험 및 분석과정에 대한 실습을 진행
     

  • 미생물 분리 실습에서는 멸균 조작, 미생물 배지 제조, 미생물 순수 분리, 장기보관용 동결건조체
    제작에 대한 실습

  • 분변 유래 혐기성 미생물 배양을 위한 혐기 챔버, 혐기 바틀 및 배지 등의 배양 조건에 관한
    교육 및 실습

     

  • 분변 유래 배양체 분석을 위한 배지 준비, 분변 시료 전처리 및 배양, 동정을 위한 PCR 증폭까지의
    과정에 관한 교육 및 실습 

     

  • FACS를 사용하는 고효율 배양 기법을 이용한 분변 유래 혐기성 미생물 배양 방법에 대하 이론적
    교육

     

  • 미생물 핵산 추출, 16S rRNA gene PCR, Sanger 시퀀싱에 대한 실험법 교육 및 염기서열 동정을 위한 데이터베이스 및 프로그램 운용법에 대한 실습
     

효능 평가 실험법 (Efficacy assessment)

  • 마이크로바이옴 기능 검증을 위한 동물 모델 기반 효능 평가 기법과 세포 수준 효능 평가 기법들에 대한 교육 및 실습
     

  • 장의 구조 및 기능 평가, 장점막 염증 및 면역표현형 분석, 분변 염증인자 정량 기법 등에 관한 실습
     

  • 질환 모델로서 궤양성 대장염 마우스의 증상, 대장의 조직병리 및 염증 정도 평가에 대한 실습
     

  • ​새포 수준 효능 평가 방법으로서 대식세포를 이용한 염증인자 생산, 세포 표면 마커 발현
    분석 및 단백질 분석에 관한 실습

바이롬 실험 및 분석법 (Virome)

  • ​​인체 시료에서 바이롬을 분석하기 위해 필요한 실험 전과정 및 분석법에 대한 이론 교육 및 실습
     

  • 인체 시료별로 바이롬 회수를 위해 필요한 전처리 실험법에 대해 실습
     

  • 전처리가 완료된 시료에서 바이러스 입자를 농축할 필요가 있을 경우 사용할 수 있는 VLP 회수 실험법에 대한 실습
     

  • 회수한 바이러스 입자의 DNA/RNA를  추출하고 whole metagenome library 제작에 
    활용하는 실습

     

  • 시퀀싱 결과에서 바이러스를 동정하기 위해 필요한 생물정보학적 분석과정에 대해
    ​이론적으로 설명함

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